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Com este Mestrado em Ecologia Aplicada pretende-se que o formando adquira uma compreensão aprofundada e especializada dos principais processos ecológicos, das questões ligadas à perda e gestão da Biodiversidade, bem como da sua importância, incluindo as interações entre as diferentes componentes, bióticas e abióticas, dos próprios Ecossistemas. Pretende-se, também, que o estudante conheça os mecanismos fisiológicos essenciais ao correto funcionamento dos indivíduos e os mecanismos de retroação envolvidos, que seja capaz de reconhecer e interpretar a Biodiversidade presente nos diversos tipos de Ecossistemas, as principais adaptações dos organismos à vida nesses ecossistemas e as principais ameaças à manutenção da Biodiversidade.